隨著第三代基因測序技術(shù)的引入，生物信息學(xué)的研究領(lǐng)域得以廣泛拓展，為深度挖掘基因信息提供了更多的可能性，同時，也帶來了海量的數(shù)據(jù)分析和處理任務(wù)。

北京希望組生物科技有限公司（下文簡稱希望組）在打造全新的三代測序項目交付平臺時，引用火山引擎 Bio-OS 解決方案，建立了基于 web 的生信數(shù)據(jù)分析平臺，不僅有效降低生信數(shù)據(jù)分析門檻，也使售后人力成本降低了 40%，運維成本降低了 30%。

希望組（Grandomics）是全球知名的三代測序技術(shù)拓展者，也是中國首家三代測序服務(wù)公司。多年來，一直專注于在三代測序平臺上進行技術(shù)開發(fā)與應(yīng)用拓展，其自主開發(fā)了基因組變異分析系統(tǒng)、單細(xì)胞測序技術(shù)等多項三代測序軟件和技術(shù)，并構(gòu)建了三代測序高性能計算集群，為客戶提供優(yōu)質(zhì)的第三代測序分析和存儲服務(wù)。

圖片來源：希望組（Grandomics）官網(wǎng)

第三代測序發(fā)展迅速，底層調(diào)度迎來挑戰(zhàn)

近年來，第三代測序技術(shù)迅速發(fā)展，為基因組研究提供了高分辨率的數(shù)據(jù)。希望組致力于打造一個三代測序項目交付平臺，通過可視化界面幫助用戶進行生信數(shù)據(jù)分析，降低難度、提高效率。然而，生信數(shù)據(jù)分析流程復(fù)雜，計算任務(wù)多且波動大，需要處理海量非結(jié)構(gòu)化文件數(shù)據(jù)。因此，希望通過異構(gòu)集群納管調(diào)度能力，實現(xiàn)資源復(fù)用，降低成本，提升集群擴容的便利性。

火山引擎 Bio-OS，助力生信數(shù)據(jù)分析

生信數(shù)據(jù)分析平臺

在火山引擎 Bio-OS 解決方案的支持下，希望組成功構(gòu)建了基于 web 的生信數(shù)據(jù)分析平臺。該平臺不僅能夠充分利用現(xiàn)有的本地計算資源進行生信計算，同時也方便其客戶通過 web 頁面提交自己所需的生信分析流程來獲取分析結(jié)果。該平臺擁有無縫集成彈性容器、海量實例快速秒級啟動、靈活應(yīng)對計算高峰等特性。此外，這些特性的引入也有效地縮減了售后支持方面的人力成本。

生信數(shù)據(jù)分析平臺的三大優(yōu)勢：

降本增效，資源利用：希望組引入 Bio-OS 方案，通過將本地的 SGE 集群納入私有集群的管理范圍，將舊有的計算資源轉(zhuǎn)化為有價值的資源，進一步提升計算效率，減少資源浪費，降低維護成本。

流程簡化，操作追溯：Bio-OS 通過在工作流中預(yù)置一系列分析步驟，希望組成功降低了生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析的門檻。實驗人員和醫(yī)生等非專業(yè)人士也能夠輕松地啟動復(fù)雜的數(shù)據(jù)分析流程，不需要深入了解技術(shù)細(xì)節(jié)。同時，通過 git 管理工作流的不同版本，確保了操作的可追溯性和回顧性。

容器集群，智能管理：在計算資源管理方面，火山引擎的 Bio-OS 方案引入了彈性容器，使系統(tǒng)能夠快速啟動和停止計算實例，以適應(yīng)計算任務(wù)的變化。特別是在處理計算高峰時，依然能夠保證系統(tǒng)高效運行，不會因為負(fù)載增加而陷入延遲。

售后成本降低 40%，運維成本降低 30%

生信數(shù)據(jù)分析平臺，有效降低了生信數(shù)據(jù)分析的門檻，讓普通人員也可輕松開啟數(shù)據(jù)分析之旅。另外，Bio-OS 納管本地 SGE 集群的功能實現(xiàn)本地算力的充分利用，在提升集群管理效率的同時，降低了 40% 售后支持人力成本和 30% 運維成本。

目前，希望組在 Bio-OS 平臺集成的 notebook 工具基礎(chǔ)上，還開發(fā)了諸如花瓣圖、動態(tài)火山圖、單細(xì)胞基因表達(dá)降維圖、單細(xì)胞降維分群圖工具等。隨著技術(shù)的不斷演進，基因測序和 Bio-OS 的結(jié)合，將擴展我們對基因組含義和應(yīng)用的理解，并創(chuàng)造出更多的發(fā)展機遇。

END

日前，火山引擎與基因會等六家生信領(lǐng)域企業(yè)，共同發(fā)布了《2023 基因行業(yè)藍(lán)皮書》。未來，火山引擎將持續(xù)為科技研發(fā)提供支持，為生物信息領(lǐng)域的創(chuàng)新發(fā)展注入更多的動力。

更多詳細(xì)內(nèi)容，請點擊閱讀原文，下載《2023 基因行業(yè)藍(lán)皮書》。

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